update config

nf-core · Oct 22, 2024 · 07dfe9a · 07dfe9a
1 parent 29d2047
commit 07dfe9a
Showing 1 changed file with 1 addition and 1 deletion.
diff --git a/conf/modules/annotate_structural_variants.config b/conf/modules/annotate_structural_variants.config
@@ -44,7 +44,7 @@ process {
             '--compress_output bgzip --distance 5000 --domains',
             '--exclude_predicted --force_overwrite --format vcf',
             '--hgvs --humdiv --max_sv_size 248956422 --merged',
-            '--dont_skip --no_progress --numbers --per_gene --polyphen p',
+            '--no_progress --numbers --per_gene --polyphen p',
             '--protein --offline --regulatory --sift p',
             '--symbol --tsl --uniprot --vcf'
         ].join(' ') }