-
Notifications
You must be signed in to change notification settings - Fork 1
Commit
This commit does not belong to any branch on this repository, and may belong to a fork outside of the repository.
Merge pull request #288 from microbiomedata/285-build-robot-templates…
…-for-envo-subset-membership non-oak discovery of EnvO class/subset relations
- Loading branch information
Showing
3 changed files
with
504 additions
and
0 deletions.
There are no files selected for viewing
250 changes: 250 additions & 0 deletions
250
notebooks/environmental_context_value_sets/nmdc_env_context_subset_membership.tsv
This file contains bidirectional Unicode text that may be interpreted or compiled differently than what appears below. To review, open the file in an editor that reveals hidden Unicode characters.
Learn more about bidirectional Unicode characters
Original file line number | Diff line number | Diff line change |
---|---|---|
@@ -0,0 +1,250 @@ | ||
ID label for convenience subset | ||
ID AI http://www.geneontology.org/formats/oboInOwl#inSubset | ||
ENVO:01001838 arid biome ENVO:03605013 | ||
ENVO:01001837 subalpine biome ENVO:03605013 | ||
ENVO:01001836 montane biome ENVO:03605013 | ||
ENVO:01000223 montane savanna biome ENVO:03605013 | ||
ENVO:01000216 montane shrubland biome ENVO:03605013 | ||
ENVO:01001835 alpine biome ENVO:03605013 | ||
ENVO:01001505 alpine tundra biome ENVO:03605013 | ||
ENVO:01001834 subpolar biome ENVO:03605013 | ||
ENVO:01001832 subtropical biome ENVO:03605013 | ||
ENVO:01001833 mediterranean biome ENVO:03605013 | ||
ENVO:01000229 mediterranean savanna biome ENVO:03605013 | ||
ENVO:01000217 mediterranean shrubland biome ENVO:03605013 | ||
ENVO:01000208 mediterranean woodland biome ENVO:03605013 | ||
ENVO:01000222 subtropical woodland biome ENVO:03605013 | ||
ENVO:01000213 subtropical shrubland biome ENVO:03605013 | ||
ENVO:01000187 subtropical savanna biome ENVO:03605013 | ||
ENVO:01001831 temperate biome ENVO:03605013 | ||
ENVO:01000221 temperate woodland biome ENVO:03605013 | ||
ENVO:01000215 temperate shrubland biome ENVO:03605013 | ||
ENVO:01000189 temperate savanna biome ENVO:03605013 | ||
ENVO:01001830 tropical biome ENVO:03605013 | ||
ENVO:01000220 tropical woodland biome ENVO:03605013 | ||
ENVO:01000214 tropical shrubland biome ENVO:03605013 | ||
ENVO:01000188 tropical savanna biome ENVO:03605013 | ||
ENVO:01000339 polar biome ENVO:03605013 | ||
ENVO:00000446 terrestrial biome ENVO:03605013 | ||
ENVO:01000219 anthropogenic terrestrial biome ENVO:03605013 | ||
ENVO:01000248 dense settlement biome ENVO:03605013 | ||
ENVO:01000249 urban biome ENVO:03605013 | ||
ENVO:01000247 rangeland biome ENVO:03605013 | ||
ENVO:01000246 village biome ENVO:03605013 | ||
ENVO:01000181 mangrove biome ENVO:03605013 | ||
ENVO:01000180 tundra biome ENVO:03605013 | ||
ENVO:01001505 alpine tundra biome ENVO:03605013 | ||
ENVO:01000176 shrubland biome ENVO:03605013 | ||
ENVO:01001369 tidal mangrove shrubland ENVO:03605013 | ||
ENVO:01000218 xeric shrubland biome ENVO:03605013 | ||
ENVO:01000216 montane shrubland biome ENVO:03605013 | ||
ENVO:01000215 temperate shrubland biome ENVO:03605013 | ||
ENVO:01000214 tropical shrubland biome ENVO:03605013 | ||
ENVO:01000213 subtropical shrubland biome ENVO:03605013 | ||
ENVO:01000217 mediterranean shrubland biome ENVO:03605013 | ||
ENVO:01000175 woodland biome ENVO:03605013 | ||
ENVO:01000222 subtropical woodland biome ENVO:03605013 | ||
ENVO:01000208 mediterranean woodland biome ENVO:03605013 | ||
ENVO:01000221 temperate woodland biome ENVO:03605013 | ||
ENVO:01000220 tropical woodland biome ENVO:03605013 | ||
ENVO:01000178 savanna biome ENVO:03605013 | ||
ENVO:01000223 montane savanna biome ENVO:03605013 | ||
ENVO:01000190 flooded savanna biome ENVO:03605013 | ||
ENVO:01000189 temperate savanna biome ENVO:03605013 | ||
ENVO:01000188 tropical savanna biome ENVO:03605013 | ||
ENVO:01000187 subtropical savanna biome ENVO:03605013 | ||
ENVO:01000229 mediterranean savanna biome ENVO:03605013 | ||
ENVO:03600036 pathogen-suppressive soil ENVO:03605015 | ||
ENVO:02000138 mangrove biome soil ENVO:03605015 | ||
ENVO:02000059 surface soil ENVO:03605015 | ||
ENVO:01001638 frost-susceptible soil ENVO:03605015 | ||
ENVO:01001616 bare soil ENVO:03605015 | ||
ENVO:01001526 frozen soil ENVO:03605015 | ||
ENVO:01001528 friable-frozen soil ENVO:03605015 | ||
ENVO:01001527 plastic-frozen soil ENVO:03605015 | ||
ENVO:01001525 hard-frozen soil ENVO:03605015 | ||
ENVO:00005765 frozen compost soil ENVO:03605015 | ||
ENVO:00002236 cryosol ENVO:03605015 | ||
ENVO:01001397 ultisol ENVO:03605015 | ||
ENVO:00002234 acrisol ENVO:03605015 | ||
ENVO:01001185 acidic soil ENVO:03605015 | ||
ENVO:00005802 bulk soil ENVO:03605015 | ||
ENVO:00005790 red soil ENVO:03605015 | ||
ENVO:00005786 upland soil ENVO:03605015 | ||
ENVO:00005769 mountain forest soil ENVO:03605015 | ||
ENVO:00002260 dune soil ENVO:03605015 | ||
ENVO:00005782 ornithogenic soil ENVO:03605015 | ||
ENVO:00005781 heat stressed soil ENVO:03605015 | ||
ENVO:00005780 greenhouse soil ENVO:03605015 | ||
ENVO:00005778 tropical soil ENVO:03605015 | ||
ENVO:00005773 pasture soil ENVO:03605015 | ||
ENVO:00005771 muddy soil ENVO:03605015 | ||
ENVO:00005768 orchid soil ENVO:03605015 | ||
ENVO:00005767 manured soil ENVO:03605015 | ||
ENVO:00005766 limed soil ENVO:03605015 | ||
ENVO:00005764 pond soil ENVO:03605015 | ||
ENVO:00005761 meadow soil ENVO:03605015 | ||
ENVO:00005760 burned soil ENVO:03605015 | ||
ENVO:00005756 lawn soil ENVO:03605015 | ||
ENVO:00005755 field soil ENVO:03605015 | ||
ENVO:00005740 paddy field soil ENVO:03605015 | ||
ENVO:00005776 peaty paddy field soil ENVO:03605015 | ||
ENVO:00005759 alluvial paddy field soil ENVO:03605015 | ||
ENVO:00005754 fertilized soil ENVO:03605015 | ||
ENVO:00005752 sawah soil ENVO:03605015 | ||
ENVO:00005751 jungle soil ENVO:03605015 | ||
ENVO:00005750 grassland soil ENVO:03605015 | ||
ENVO:00005777 steppe soil ENVO:03605015 | ||
ENVO:00005746 savanna soil ENVO:03605015 | ||
ENVO:00005749 farm soil ENVO:03605015 | ||
ENVO:00005788 rubber plantation soil ENVO:03605015 | ||
ENVO:00005772 orchard soil ENVO:03605015 | ||
ENVO:00005748 dry soil ENVO:03605015 | ||
ENVO:00005747 compost soil ENVO:03605015 | ||
ENVO:00005743 roadside soil ENVO:03605015 | ||
ENVO:00005742 arable soil ENVO:03605015 | ||
ENVO:00005741 alpine soil ENVO:03605015 | ||
ENVO:00002871 alluvial soil ENVO:03605015 | ||
ENVO:00005759 alluvial paddy field soil ENVO:03605015 | ||
ENVO:00005758 alluvial swamp soil ENVO:03605015 | ||
ENVO:00002275 technosol ENVO:03605015 | ||
ENVO:00002274 stagnosol ENVO:03605015 | ||
ENVO:00002273 fluvisol ENVO:03605015 | ||
ENVO:00002263 garden soil ENVO:03605015 | ||
ENVO:00005779 vegetable garden soil ENVO:03605015 | ||
ENVO:00005744 allotment garden soil ENVO:03605015 | ||
ENVO:00002262 clay soil ENVO:03605015 | ||
ENVO:00002261 forest soil ENVO:03605015 | ||
ENVO:00005787 eucalyptus forest soil ENVO:03605015 | ||
ENVO:00005784 spruce forest soil ENVO:03605015 | ||
ENVO:00005783 leafy wood soil ENVO:03605015 | ||
ENVO:00005770 beech forest soil ENVO:03605015 | ||
ENVO:00002259 agricultural soil ENVO:03605015 | ||
ENVO:00005789 bluegrass field soil ENVO:03605015 | ||
ENVO:00002258 loam ENVO:03605015 | ||
ENVO:06105277 clay loam ENVO:03605015 | ||
ENVO:06105278 silty clay loam ENVO:03605015 | ||
ENVO:06105276 sandy clay loam ENVO:03605015 | ||
ENVO:06105275 silty loam ENVO:03605015 | ||
ENVO:06105274 sandy loam ENVO:03605015 | ||
ENVO:00002257 podzol ENVO:03605015 | ||
ENVO:00002256 regosol ENVO:03605015 | ||
ENVO:00002255 solonetz ENVO:03605015 | ||
ENVO:00002254 vertisol ENVO:03605015 | ||
ENVO:00002253 umbrisol ENVO:03605015 | ||
ENVO:00002252 solonchak ENVO:03605015 | ||
ENVO:00002251 planosol ENVO:03605015 | ||
ENVO:00002250 plinthosol ENVO:03605015 | ||
ENVO:00002249 phaeozem ENVO:03605015 | ||
ENVO:00002248 luvisol ENVO:03605015 | ||
ENVO:00002247 nitisol ENVO:03605015 | ||
ENVO:00002246 ferralsol ENVO:03605015 | ||
ENVO:00002245 gypsisol ENVO:03605015 | ||
ENVO:00002244 gleysol ENVO:03605015 | ||
ENVO:00002243 histosol ENVO:03605015 | ||
ENVO:00005774 peat soil ENVO:03605015 | ||
ENVO:00002242 lixisol ENVO:03605015 | ||
ENVO:00002241 leptosol ENVO:03605015 | ||
ENVO:00002240 kastanozem ENVO:03605015 | ||
ENVO:00002239 calcisol ENVO:03605015 | ||
ENVO:00002238 durisol ENVO:03605015 | ||
ENVO:00002237 chernozem ENVO:03605015 | ||
ENVO:00002235 cambisol ENVO:03605015 | ||
ENVO:00002233 albeluvisol ENVO:03605015 | ||
ENVO:00002232 andosol ENVO:03605015 | ||
ENVO:01001841 volcanic soil ENVO:03605015 | ||
ENVO:00002231 alisol ENVO:03605015 | ||
ENVO:00002230 anthrosol ENVO:03605015 | ||
ENVO:00002229 arenosol ENVO:03605015 | ||
ENVO:01000813 astronomical body part ENVO:03605014 | ||
ENVO:01000687 coast ENVO:03605014 | ||
ENVO:00000191 solid astronomical body part ENVO:03605014 | ||
ENVO:01001886 landform ENVO:03605014 | ||
ENVO:03000117 channel ENVO:03605014 | ||
ENVO:00000068 tunnel ENVO:03605014 | ||
ENVO:01001884 surface landform ENVO:03605014 | ||
ENVO:01001357 desert ENVO:03605014 | ||
ENVO:01000302 outcrop ENVO:03605014 | ||
ENVO:00000537 boulder field ENVO:03605014 | ||
ENVO:00000533 landfill ENVO:03605014 | ||
ENVO:00000516 hummock ENVO:03605014 | ||
ENVO:00000508 terrace ENVO:03605014 | ||
ENVO:00000305 peninsula ENVO:03605014 | ||
ENVO:00000304 shore ENVO:03605014 | ||
ENVO:00000382 lake shore ENVO:03605014 | ||
ENVO:00000277 dry lake ENVO:03605014 | ||
ENVO:00000175 karst ENVO:03605014 | ||
ENVO:00000174 isthmus ENVO:03605014 | ||
ENVO:00000127 badland ENVO:03605014 | ||
ENVO:00000094 volcanic feature ENVO:03605014 | ||
ENVO:00000398 volcanic cone ENVO:03605014 | ||
ENVO:01000664 tuff cone ENVO:03605014 | ||
ENVO:00000091 beach ENVO:03605014 | ||
ENVO:00000086 plain ENVO:03605014 | ||
ENVO:00000067 cave ENVO:03605014 | ||
ENVO:00000027 spring ENVO:03605014 | ||
ENVO:00002000 slope ENVO:03605014 | ||
ENVO:01000334 talus slope ENVO:03605014 | ||
ENVO:01000333 hillside ENVO:03605014 | ||
ENVO:00000178 levee ENVO:03605014 | ||
ENVO:00000141 bank ENVO:03605014 | ||
ENVO:00000087 cliff ENVO:03605014 | ||
ENVO:00000480 peak ENVO:03605014 | ||
ENVO:00000309 depressed landform ENVO:03605014 | ||
ENVO:03000015 geographic basin ENVO:03605014 | ||
ENVO:00000100 valley ENVO:03605014 | ||
ENVO:00000169 canyon ENVO:03605014 | ||
ENVO:00000128 dry valley ENVO:03605014 | ||
ENVO:00000248 glacial valley ENVO:03605014 | ||
ENVO:01001871 pit ENVO:03605014 | ||
ENVO:01000649 trench ENVO:03605014 | ||
ENVO:00000543 swale ENVO:03605014 | ||
ENVO:00000514 crater ENVO:03605014 | ||
ENVO:01001071 impact crater ENVO:03605014 | ||
ENVO:00000246 volcanic crater ENVO:03605014 | ||
ENVO:00000096 caldera ENVO:03605014 | ||
ENVO:00000395 channel of a watercourse ENVO:03605014 | ||
ENVO:00000394 strait ENVO:03605014 | ||
ENVO:00000278 dry stream ENVO:03605014 | ||
ENVO:01000995 dry river ENVO:03605014 | ||
ENVO:00000121 artificial channel ENVO:03605014 | ||
ENVO:01000924 plumbing drain ENVO:03605014 | ||
ENVO:00000037 ditch ENVO:03605014 | ||
ENVO:00000195 sinkhole ENVO:03605014 | ||
ENVO:00000176 elevated landform ENVO:03605014 | ||
ENVO:01001491 flattened elevation ENVO:03605014 | ||
ENVO:00000287 butte ENVO:03605014 | ||
ENVO:00000182 plateau ENVO:03605014 | ||
ENVO:00000179 mesa ENVO:03605014 | ||
ENVO:00000481 pinnacle ENVO:03605014 | ||
ENVO:00000477 mount ENVO:03605014 | ||
ENVO:00000083 hill ENVO:03605014 | ||
ENVO:00000170 dune ENVO:03605014 | ||
ENVO:00000081 mountain ENVO:03605014 | ||
ENVO:00000283 ridge ENVO:03605014 | ||
ENVO:01001781 part of a landmass ENVO:03605014 | ||
ENVO:00000305 peninsula ENVO:03605014 | ||
ENVO:01000667 geological fracture ENVO:03605014 | ||
ENVO:01000670 vein ENVO:03605014 | ||
ENVO:01000668 geological fault ENVO:03605014 | ||
ENVO:01000669 active geological fault ENVO:03605014 | ||
ENVO:00000247 volcano ENVO:03605014 | ||
ENVO:01000352 field ENVO:03605014 | ||
ENVO:01000437 lava field ENVO:03605014 | ||
ENVO:00000548 gravel field ENVO:03605014 | ||
ENVO:00000444 woodland clearing ENVO:03605014 | ||
ENVO:00000114 agricultural field ENVO:03605014 | ||
ENVO:00000146 snow field ENVO:03605014 | ||
ENVO:00000000 geographic feature ENVO:03605014 | ||
ENVO:00000012 hydrographic feature ENVO:03605014 | ||
ENVO:01001899 reef ENVO:03605014 | ||
ENVO:00000475 inlet ENVO:03605014 | ||
ENVO:00000167 bar ENVO:03605014 | ||
ENVO:00000420 tombolo ENVO:03605014 | ||
ENVO:00000002 anthropogenic geographic feature ENVO:03605014 | ||
ENVO:03600053 yard ENVO:03605014 | ||
ENVO:03600033 residential backyard ENVO:03605014 | ||
ENVO:01000987 market ENVO:03605014 | ||
ENVO:00000562 park ENVO:03605014 | ||
ENVO:00000026 well ENVO:03605014 | ||
ENVO:00000011 garden ENVO:03605014 |
This file contains bidirectional Unicode text that may be interpreted or compiled differently than what appears below. To review, open the file in an editor that reveals hidden Unicode characters.
Learn more about bidirectional Unicode characters
Oops, something went wrong.