_patolog.qmd

# Patolog

## Alışkanlıklar


::: {.panel-tabset}

### Zorluklar

![](./media/patolog-cekinceler.png)


### Kolaylıklar

- Validasyon çalışmaları: Alışma süreci

:::

## Alışkanlıklar - 2

![](./media/dunyanin-en-acil-taramasi-2.png)

![](./media/tarama-suresi.JPG)

## Ekran

::: {.panel-tabset}

### Zorluklar

- Yeni kuşak patolojinin yeni ergonomi sorunları
- Yeni bir postür
- Yeni bir çalışma düzeni

### Kolaylıklar

- Geniş alanda bakma.
- 1x, 2x büyütme

![](./media/leeds-screen-test.png)

- ICC profile

![](./media/leeds-screen-test-2.png)


:::{.footer}
[Point of Use QA Pathology](https://www.virtualpathology.leeds.ac.uk/research/systems/pouqa/pathology/)
:::

:::



## Navigasyon


::: {.panel-tabset}

### Zorluklar

- Yeni kuşak patolojinin yeni ergonomi sorunları
- Kas hafızası 

<!-- [![](./media/magnus-muscle-memory.png)](https://twitter.com/FIDE_chess/status/1693220998202499482) -->

<blockquote class="twitter-tweet"><p lang="en" dir="ltr">When your muscle memory kicks in and you try to shake hands before the game, but your opponent is missing! <a href="https://twitter.com/hashtag/FIDEWorldCup?src=hash&amp;ref_src=twsrc%5Etfw">#FIDEWorldCup</a> <a href="https://t.co/yInEUqpyJC">pic.twitter.com/yInEUqpyJC</a></p>&mdash; International Chess Federation (@FIDE_chess) <a href="https://twitter.com/FIDE_chess/status/1693220998202499482?ref_src=twsrc%5Etfw">August 20, 2023</a></blockquote> <script async src="https://platform.twitter.com/widgets.js" charset="utf-8"></script>


### Kolaylıklar

![](./media/navigasyon-Conventional-Mouse-a-Trackballs-1-b-2-c-and-3-d-Vertical-Mouse-e.png)


![](./media/navigasyon-mouse.jpg)


<!-- {{< video https://www.youtube.com/embed/GFFK-d_Hua8 width="100%" >}} -->


{{< video ./media/navigation-digital-pathology.mp4 >}}


{{< video ./media/sectra-middle-click-pan-image.mp4 >}}


<!-- {{< video https://www.youtube.com/embed/PkWkjmghLAc width="100%" >}} -->


:::


## Navigasyon <br> Çoklu (Senkron) Ekran


{{< video ./media/coklu-senkron-ekran.mp4 >}}


## Not yazma

- Manuel notlar

![](./media/mapeye-not.png)


- Dijital notlar

![](./media/dijitale-not.jpg)



- Standart notlar?


![](./media/standardized-clinical-annotation.jpg)


::: {.footer}
Standardized Clinical Annotation of Digital Histopathology Slides at the Point of Diagnosis <br>
Modern Pathology Volume 36, Issue 11, November 2023, 100297
:::






## Vakanın tümü tarandı mı?


<!-- ![](./media/sectra-inceleme-etkinlik-izi.jpg) -->

::: {.panel-tabset}

### Zorluklar

- Radyoloji mantığında tekniker görüntüleri hazırlayıp gönderiyor
- Patolojide tüm lamların tarandığından emin olmak lazım


### Kolaylıklar

- Eğer PBYS yeterli ise her lamın bilgisi olacağından eksik lamlar tespit edilecektir.
- Sadece blok sayısını karşılaştırmak yeterli değil:
  - Sitoloji
  - (İmmüno)histokimya
  - yeni kesitler, çoklu kesitler


:::


## Lamın tümü tarandı mı?


![](./media/eksik-tarama.png)

![](./media/eksik-doku.png)

![](./media/eksik-doku-2.png)

![](./media/bosluklar.png)



## Lamın tümü tarandı mı?


::: {.panel-tabset}

### Zorluklar

- Tüm lamı tararsak boşluklar gereksiz yer kaplıyor. 
- Otomatik doku tespiti küçük dokuları atlayabiliyor. 

### Kolaylıklar

- Boş şeritleri atlayarak tarama.
- Otomatik doku tespiti. 
- Alan seçerek tarama. 
- Literatürde atlanan küçük dokuların tanısal sorun yaratmadığına dair çalışmalar var.
  - Ama bu patolog obsesyonuna çare değil. 


:::

:::{.footer}
Potential quality pitfalls of digitalized whole slide image of breast pathology in routine practice <br> Mod Pathol 35, 903–910 (2022)
:::




## Lamın tümüne baktık mı?

::: {.panel-tabset}

### Cama işaretleme

![](./media/navigasyon-preparat.jpg)


### Dijital işaretleme

{{< video ./media/sectra-navigasyon-heatmap.mp4 >}}


:::


## Çalışma Hayatı


::: {.panel-tabset}

### Zorluklar

- Her zaman, her yerde çalışma.


[![](./media/working-from-home-saturday.jpg)](https://twitter.com/PHDcomics/status/1708135811286266198?s=20)


<blockquote class="twitter-tweet"><p lang="es" dir="ltr">A pro con <a href="https://t.co/wIGmTYCivo">pic.twitter.com/wIGmTYCivo</a></p>&mdash; PHD Comics (@PHDcomics) <a href="https://twitter.com/PHDcomics/status/1708135811286266198?ref_src=twsrc%5Etfw">September 30, 2023</a></blockquote> <script async src="https://platform.twitter.com/widgets.js" charset="utf-8"></script> 




### Kolaylıklar

- İstediğin zaman, istediğin yerde çalışabilme.  
- Şehir, ülke, saat sınırlaması kalmadı. 
- Yurtdışında çoğu merkez konsültasyon için dijital görüntüleri kabul etmeye başladı. 
- Konsültasyon kolaylaştı. 
- İş listeleri

![](./media/is-listeleri.jpg)



:::