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Módulo principal para a execução de experimentos da ferramenta, responsável pelo fluxo de execução, parâmetros de entrada, log de dados e organização dos dados de saída.
Funções:
- run_experiment : Função responsável pelo principal fluxo de execução da cGAN.
- get_adversarial_model : Função utilizada para a chamada do método de instanciamento da rede adversarial cGAN.
- show_and_export_results : Função para demonstrar e exportar resultados de métricas de fidelidade e utilidade, além da chamada de criação dos plots destas métricas.
- comparative_data : Função para a comparação entres os dados sintéticos com dados reais usando métricas de fidelidade (Similaridade de cosseno, erro quadrático médio.
- evaluate_TRTS_data, evaluate_TSTR_data :Cálculo das métricas de utilidade dos classificadores.
- p_value_test : A funlção calcula o valor-p (p-value) utilizando o teste de Wilcoxon para amostras pareadas das métricas de utilidade dos classificadores.
- generate_sample : Função utilizada para a geração de amostras sintéticas usando o modelo gerador da cGAN. Utilizado para gerar os datatsets S e s.
- plot_to_image : Converte um gráfico Matplotlib em uma imagem utilizável pelo TensorBoard.
- show_all_settings : Função exibe todas as configurações do experimento nos logs.
- show_model : A função imprime os parametros da rede adversarial no log de saida
- initial_step : A função realiza a configuração inicial do experimento; salvamento dos argumentos da linha de comando e o Carregamento do dataset e estabelecimento da forma dos dados de entrada.
- create_argparse : Estabelece a lista de parâmetros de entradas para o argparse.
"""
## Importação de bibliotecas necessárias
try:
import json
import os
import sys
import logging
import datetime
import time
import argparse
import warnings
import ssl
import csv
import math
from sklearn.metrics import log_loss
from logging.handlers import RotatingFileHandler
import mlflow
import numpy as np
import pandas as pd
import matplotlib.pyplot as plt
from aim import Image, Distribution,Run
from pathlib import Path
import tensorflow as tf
import scipy.stats as stats
from tensorflow.keras.losses import BinaryCrossentropy
from sklearn.model_selection import StratifiedKFold
import sklearn
from sklearn import metrics
from sklearn.metrics import confusion_matrix
import requests
from Models.ConditionalGANModel import ConditionalGAN
from Models.AdversarialModel import AdversarialModel
from Models.Classifiers import Classifiers
import scipy.stats
from sklearn import svm
import keras
import mlflow.models
from sklearn.linear_model import SGDRegressor
from Tools.tools import PlotConfusionMatrix
from Tools.tools import PlotFidelityeMetrics
from Tools.tools import PlotCurveLoss
from Tools.tools import ProbabilisticMetrics
from Tools.tools import PlotClassificationMetrics
from Tools.tools import DEFAULT_COLOR_NAME
from sklearn.linear_model import SGDClassifier
import neptune
from mlflow.models import infer_signature
from tensorflow.keras.callbacks import TensorBoard
import io
import pickle
## Definição de flags de uso de ferramentas
USE_AIM=False
USE_MLFLOW=False
USE_NEPTUNE=False
USE_TENSORBOARD=False
os.environ["KERAS_BACKEND"] = "tensorflow"
except ImportError as error:
## Tratamento de erro de dependências
print(error)
print()
print("1. (optional) Setup a virtual environment: ")
print(" python3 - m venv ~/Python3env/MalSynGen")
print(" source ~/Python3env/MalSynGen/bin/activate ")
print()
print("2. Install requirements:")
print(" pip3 install --upgrade pip")
print(" pip3 install -r requirements.txt ")
print()
sys.exit(-1)
## Configurações de log e supressão de avisos
##Os niveis de verbosidade do log podem ser INFO (1) ou DEBUG (2).
os.environ['TF_CPP_MIN_LOG_LEVEL'] = '2'
tf_logger = logging.getLogger('tensorflow')
tf_logger.setLevel(logging.ERROR)
warnings.filterwarnings("ignore", category=FutureWarning)
with warnings.catch_warnings():
warnings.filterwarnings("ignore", message=".*the default value of `keepdims` will become False.*")
warnings.filterwarnings("ignore", message="Variables are collinear")
## Definição de configurações padrão da rede cGAN
DEFAULT_VERBOSITY = logging.INFO
TIME_FORMAT = '%Y-%m-%d,%H:%M:%S'
DEFAULT_DATA_TYPE = "float32"
##Número padrão de amostras malware a serem geradas.
DEFAULT_NUMBER_GENERATE_MALWARE_SAMPLES = 2000
## Número padrão de amostras beningas a serem geradas.
DEFAULT_NUMBER_GENERATE_BENIGN_SAMPLES = 2000
##Número padrão de épocas (iterações de treinamento) da cGAN.
DEFAULT_NUMBER_EPOCHS_CONDITIONAL_GAN = 100
##Número padrão de dobras a serem utilizados
DEFAULT_NUMBER_STRATIFICATION_FOLD = 5
##Número padrão de camadas latentes
DEFAULT_ADVERSARIAL_LATENT_DIMENSION = 128
## Algoritmo padrão de treinamento para cGAN. Opções: 'Adam', 'RMSprop', 'Adadelta'.
DEFAULT_ADVERSARIAL_TRAINING_ALGORITHM = "Adam"
##Função de ativação padrão da cGAN. Opções: 'LeakyReLU', 'ReLU', 'PRe
DEFAULT_ADVERSARIAL_ACTIVATION = "LeakyReLU" ## ['LeakyReLU', 'ReLU', 'PReLU']
## Valor padrão para a taxa de decaimento do dropout do gerador da cGAN.
DEFAULT_ADVERSARIAL_DROPOUT_DECAY_RATE_G = 0.2
## Valor padrão para a taxa de decaimento do dropout do discriminador da cGAN.
DEFAULT_ADVERSARIAL_DROPOUT_DECAY_RATE_D = 0.4
##Valor padrão para a central da distribuição gaussiana do inicializador.
DEFAULT_ADVERSARIAL_INITIALIZER_MEAN = 0.0
## Valor padrão para desvio padrão da distribuição gaussiana do inicializador.
DEFAULT_ADVERSARIAL_INITIALIZER_DEVIATION = 0.02
##Tamanho de lota padrão da cGAN. Opções: 16, 32, 64,128,256
DEFAULT_ADVERSARIAL_BATCH_SIZE = 32
##Valor padrão para número de neurônios das camadas densas do gerador.
DEFAULT_ADVERSARIAL_DENSE_LAYERS_SETTINGS_G = [512]
##Valor padrão para número de neurônios das camadas densas do discriminador.
DEFAULT_ADVERSARIAL_DENSE_LAYERS_SETTINGS_D = [512]
##Valor padrão para a média da distribuição do ruído aleatório de entrada.
DEFAULT_ADVERSARIAL_RANDOM_LATENT_MEAN_DISTRIBUTION = 0.0
##Valor para o desvio padrão do ruído aleatório de entrada
DEFAULT_ADVERSARIAL_RANDOM_LATENT_STANDER_DEVIATION = 1.0
##Configurações a função de ativação da última camada
DEFAULT_CONDITIONAL_LAST_ACTIVATION_LAYER = "sigmoid"
##Configurações do perceptron
DEFAULT_PERCEPTRON_TRAINING_ALGORITHM = "Adam"
DEFAULT_PERCEPTRON_LOSS = "binary_crossentropy"
DEFAULT_PERCEPTRON_DENSE_LAYERS_SETTINGS = [512, 256, 256]
DEFAULT_PERCEPTRON_DROPOUT_DECAY_RATE = 0.2
DEFAULT_PERCEPTRON_METRIC = ["accuracy"]
## Valor padrão para a opção de salvar modelos: True ou False
DEFAULT_SAVE_MODELS = True
##Caminhos para os arquivos de saida
DEFAULT_OUTPUT_PATH_CONFUSION_MATRIX = "confusion_matrix"
DEFAULT_OUTPUT_PATH_TRAINING_CURVE = "training_curve"
##Classificadores utilizados por padrão. Opções: RandomForest, SupportVectorMachine, DecisionTree, AdaBoost, Perceptron, SGDRegressor, XGboost
DEFAULT_CLASSIFIER_LIST = ["RandomForest", "SupportVectorMachine","DecisionTree", "AdaBoost","Perceptron","SGDRegressor","XGboost"]
"""
Nível de verbosidade das mensagens durante o treinanmento da cGAN
"""
DEFAULT_VERBOSE_LIST = {logging.INFO: 2, logging.DEBUG: 1, logging.WARNING: 2,
logging.FATAL: 0, logging.ERROR: 0}
"""
Novo do arquivo onde serão salvos os logs de execução
"""
LOGGING_FILE_NAME = "logging.log"
aim_run = None
callbacks = None
file_writer = None
## Definição de tipos de argumentos personalizados para argparse
def list_of_ints(arg):
return list(map(int, arg.split(',')))
def list_of_strs(arg):
return list(map(str, arg.split(',')))
def generate_samples(instance_model, number_instances, latent_dimension, label_class, verbose_level,
latent_mean_distribution, latent_stander_deviation):
"""
Função utilizada para a geração de amostras sintéticas usando o modelo gerador da cGAN. Utilizado para gerar os datatsets S e s
Parâmetros:
- instance_model: modelo gerador
- number_instances: número de amostras a serem geradas
- latent_dimension: dimensão do vetor latente
- label_class: classe das amostras (1 para malware, 0 para benigno)
- verbose_level: nível de verbosidade
- latent_mean_distribution: média da distribuição latente
- latent_stander_deviation: desvio padrão da distribuição latente
Retorna:
- generated_samples: amostras geradas
- label_samples_generated: rótulos das amostras geradas
"""
if np.ceil(label_class) == 1:
label_samples_generated = np.ones(number_instances, dtype=np.float32)
label_samples_generated = label_samples_generated.reshape((number_instances, 1))
else:
label_samples_generated = np.zeros(number_instances, dtype=np.float32)
label_samples_generated = label_samples_generated.reshape((number_instances, 1))
latent_noise = np.random.normal(latent_mean_distribution, latent_stander_deviation,
(number_instances, latent_dimension))
generated_samples = instance_model.generator.predict([latent_noise, label_samples_generated], verbose=verbose_level)
generated_samples = np.rint(generated_samples)
return generated_samples, label_samples_generated
def plot_to_image(figure):
"""
Converte um gráfico Matplotlib em uma imagem utilizável pelo TensorBoard.
Parâmetros:
- figure: figura Matplotlib
Retorna:
- digit: imagem decodificada
"""
buf = io.BytesIO()
plt.savefig(buf, format='png')
plt.close(figure)
buf.seek(0)
digit = tf.image.decode_png(buf.getvalue(), channels=4)
digit = tf.expand_dims(digit, 0)
return digit
def comparative_data(fold, x_synthetic, real_data, label):
"""
Função para a comparação entres os dados sintéticos com dados reais usando métricas de fidelidade (Similaridade de cosseno, erro quadrático médio
Parâmetros:
- fold: índice da iteração atual
- x_synthetic: dados sintéticos
- real_data: dados reais
- label: rótulo dos dados
Retorna:
- lista com métricas de similaridade
"""
instance_metrics = ProbabilisticMetrics()
synthetic_mean_squared_error = instance_metrics.get_mean_squared_error(real_data, x_synthetic)
synthetic_cosine_similarity = instance_metrics.get_cosine_similarity(real_data, x_synthetic)
synthetic_maximum_mean_discrepancy = instance_metrics.get_maximum_mean_discrepancy(real_data, x_synthetic)
logging.info(f"Similarity Metrics")
logging.info(f" Synthetic Fold {fold + 1} {label} - Mean Squared Error: " + str(synthetic_mean_squared_error))
logging.info(f" Synthetic Fold {fold + 1} {label} - Cosine Similarity: " + str(synthetic_cosine_similarity))
logging.info(f" Synthetic Fold {fold + 1} {label} - Maximum Mean Discrepancy: " + str(synthetic_maximum_mean_discrepancy))
logging.info("")
return [synthetic_mean_squared_error,synthetic_cosine_similarity,synthetic_maximum_mean_discrepancy]
def evaluate_TRTS_data(list_classifiers, x_TRTS, y_TRTS, fold, k, generate_confusion_matrix,
output_dir, classifier_type, out_label, path_confusion_matrix, verbose_level, dict, TRTS_aucs):
"""
Avalia os do classificador TRTS (Treinado com dados reais/ Avaliado com dados sintéticos)
Parâmetros:
- list_classifiers: lista de classificadores
- x_TRTS: dados utilizada para evaluar os classificadores TRTS
- y_TRTS: rótulos dos dados de avaliação
- fold: índice da iteração atual
- k: índice da subdivisão atual
- generate_confusion_matrix: flag para geração de matriz de confusão
- output_dir: diretório de saída
- classifier_type: tipo de classificador
- out_label: rótulo de saída
- path_confusion_matrix: caminho para salvar matriz de confusão
- verbose_level: nível de verbosidade
- dict: dicionário para armazenar resultados das métricas de utilidade
- TRTS_aucs: lista para armazenar AUCs dos classificadore TRTS
Retorna:
- dict: dicionário atualizado com resultados
- TRTS_aucs: lista atualizada com AUCs
"""
instance_metrics = ProbabilisticMetrics()
y_predict_prob=[]
logging.info(f"TRTS Fold {fold + 1}/{k} results\n")
## Itera sobre a lista dos classificadores
for index, classifier_model in enumerate(list_classifiers):
## obtém a predição do classificador em relação aos dados
if classifier_type[index] == "Perceptron":
y_predicted_TRTS = classifier_model.predict(x_TRTS, verbose=DEFAULT_VERBOSE_LIST[verbose_level])
y_predicted_TRTS = np.rint(np.squeeze(y_predicted_TRTS, axis=1))
y_predict_prob=y_predicted_TRTS
else:
y_predicted_TRTS = classifier_model.predict(x_TRTS)
y_predict_prob=classifier_model.predict_proba(x_TRTS)[::,1]
y_predicted_TRTS = y_predicted_TRTS.astype(int)
y_TRTS = y_TRTS.astype(int)
##cria uma matrix de confusão
confusion_matrix_TRTS = confusion_matrix(y_TRTS, y_predicted_TRTS)
##Obtem as métricas de utilidade do classificador
accuracy_TRTS = instance_metrics.get_accuracy(y_TRTS, y_predicted_TRTS)
precision_TRTS = instance_metrics.get_precision(y_TRTS, y_predicted_TRTS)
recall_TRTS = instance_metrics.get_recall(y_TRTS, y_predicted_TRTS)
f1_score_TRTS = instance_metrics.get_f1_score(y_TRTS, y_predicted_TRTS)
##Realiza o logging das métricas de fidelidade obtidas
logging.info(f" Classifier Model: {classifier_type[index]}")
logging.info(f" TRTS Fold {fold + 1} - Confusion Matrix:")
logging.info(confusion_matrix_TRTS)
logging.info(f"\n Classifier Metrics:")
logging.info(f" TRTS Fold {fold + 1} - Accuracy: " + str(accuracy_TRTS))
logging.info(f" TRTS Fold {fold + 1} - Precision: " + str(precision_TRTS))
logging.info(f" TRTS Fold {fold + 1} - Recall: " + str(recall_TRTS))
logging.info(f" TRTS Fold {fold + 1} - F1 Score: " + str(f1_score_TRTS) + "\n")
## cria uma lista com os nomes das métricas, será utilizada pelas ferramentas de rastreamento
ac='TRTS Accuracy '+f' Classifier Model {classifier_type[index]}'
pc='TRTS Precision '+f' Classifier Model {classifier_type[index]}'
rr='TRTS Recall '+f' Classifier Model {classifier_type[index]}'
f1='TRTS f1 Score '+f' Classifier Model {classifier_type[index]}'
values={ac:accuracy_TRTS,pc:precision_TRTS,rr:recall_TRTS,f1:f1_score_TRTS}
##Salvamento das métricas no dicionário de métricas
dict["TRTS accuracy"][classifier_type[index]].append(accuracy_TRTS)
dict["TRTS precision"][classifier_type[index]].append(precision_TRTS)
dict["TRTS F1 score"][classifier_type[index]].append(f1_score_TRTS)
dict["TRTS recall"][classifier_type[index]].append(recall_TRTS)
##calculo das métricas da curva de ROC
fpr, tpr,thresholds=sklearn.metrics.roc_curve(y_TRTS, y_predict_prob)
##plot da figura da curva de ROC
plt.figure()
Path(os.path.join(output_dir, path_confusion_matrix)).mkdir(parents=True, exist_ok=True)
roc_file = os.path.join(output_dir, path_confusion_matrix,f'Roc_curve_TRTS_{classifier_type[index]}_k{fold + 1}.jpg')
auc=metrics.roc_auc_score(y_TRTS, y_predict_prob)
plt.plot(fpr, tpr)
plt.savefig(roc_file, bbox_inches="tight")
##Salvamento do AUC no dicnário TRTS
TRTS_aucs[classifier_type[index]].append(auc)
if generate_confusion_matrix:
##realiza o plot da figura da matrix de confusão
plt.figure()
selected_color_map = plt.colormaps.get_cmap(DEFAULT_COLOR_NAME[(fold + 2) % len(DEFAULT_COLOR_NAME)])
confusion_matrix_instance = PlotConfusionMatrix()
confusion_matrix_instance.plot_confusion_matrix(confusion_matrix_TRTS, out_label, selected_color_map)
Path(os.path.join(output_dir, path_confusion_matrix)).mkdir(parents=True, exist_ok=True)
matrix_file = os.path.join(output_dir, path_confusion_matrix,
f'CM_TRTS_{classifier_type[index]}_k{fold + 1}.jpg')
plt.savefig(matrix_file, bbox_inches='tight')
## opção para salvamento das figuras geradas e as métricas obtidas, na ferramenta de rastreamento Aimstack
if USE_AIM:
aim_run.track(values)
plt.savefig(matrix_file, bbox_inches='tight')
aim_image = Image(matrix_file)
aim_run.track(value=aim_image,name= f'CM_TRTS_{classifier_type[index]}_k{fold + 1}')
## opção para salvamento das figuras geradas e as métricas obtidas, na ferramenta de rastreamento Mlflow
if USE_MLFLOW:
mlflow.log_metrics(values,step=fold+1)
mlflow.log_artifact(matrix_file, 'images')
## opção para salvamento das figuras geradas e as métricas obtidas, na ferramenta de rastreamento TensorBoard
if USE_TENSORBOARD:
with file_writer.as_default():
cm_image = plot_to_image(matrix_file)
tf.summary.image(f'CM_TSTR_{classifier_type[index]}_k{fold + 1}', cm_image,step=fold+1)
tf.summary.scalar(ac, data=accuracy_TRTS, step=fold+1)
tf.summary.scalar(pc, data=precision_TRTS, step=fold+1)
tf.summary.scalar(rr, data=recall_TRTS, step=fold+1)
tf.summary.scalar(f1, data=f1_score_TRTS, step=fold+1)
def evaluate_TSTR_data(list_classifiers, x_TSTR, y_TSTR, fold, k, generate_confusion_matrix, output_dir,
classifier_type, out_label, path_confusion_matrix, verbose_level,dict,TSTR_aucs):
"""
Avalia os do classificador TSTR(Treinado com dados sintéticos/ Avaliado com dados reais)
Parâmetros:
- list_classifiers: lista de classificadores
- x_TSTR: dados utilizada para evaluar os classificadores TSTR
- y_TSTR: rótulos dos dados de avaliação
- fold: índice da iteração atual
- k: índice da subdivisão atual
- generate_confusion_matrix: flag para geração de matriz de confusão
- output_dir: diretório de saída
- classifier_type: tipo de classificador
- out_label: rótulo de saída
- path_confusion_matrix: caminho para salvar matriz de confusão
- verbose_level: nível de verbosidade
- dict: dicionário para armazenar resultados das métricas de utilidade
- TSTR_aucs: lista para armazenar AUCs dos classificadores TSTR
Retorna:
- dict: dicionário atualizado com resultados
- TSTR_aucs: lista atualizada com AUCs
"""
logging.info(f"TSTR Fold {fold + 1}/{k} results")
instance_metrics = ProbabilisticMetrics()
y_predict_prob=[]
## Itera sobre a lista dos classificadores
for index, classifier_model in enumerate(list_classifiers):
## obtém a predição do classificador em relação aos dados
if classifier_type[index] == "Perceptron":
y_predicted_TSTR = classifier_model.predict(x_TSTR, verbose=DEFAULT_VERBOSE_LIST[verbose_level])
y_predicted_TSTR = np.rint(np.squeeze(y_predicted_TSTR, axis=1))
y_predict_prob=y_predicted_TSTR
else:
print(classifier_type[index])
y_predicted_TSTR = classifier_model.predict(x_TSTR)
y_predict_prob=classifier_model.predict_proba(x_TSTR)[::,1]
y_predicted_TSTR = y_predicted_TSTR.astype(int)
y_sample_TSTR = y_TSTR.astype(int)
##cria uma matrix de confusão
confusion_matrix_TSTR = confusion_matrix(y_sample_TSTR, y_predicted_TSTR)
##Obtem as métricas de utilidade do classificador
accuracy_TSTR = instance_metrics.get_accuracy(y_sample_TSTR, y_predicted_TSTR)
precision_TSTR = instance_metrics.get_precision(y_sample_TSTR, y_predicted_TSTR)
recall_TSTR = instance_metrics.get_recall(y_sample_TSTR, y_predicted_TSTR)
f1_TSTR = instance_metrics.get_f1_score(y_sample_TSTR, y_predicted_TSTR)
##Realiza o logging das métricas de fidelidade obtidas
logging.info(f" Classifier Model: {classifier_type[index]}")
logging.info(f" TSTR Fold {fold + 1} - Confusion Matrix:")
logging.info(confusion_matrix_TSTR)
logging.info(f"\n Classifier Metrics:")
logging.info(f" TSTR Fold {fold + 1} - Accuracy: " + str(accuracy_TSTR))
logging.info(f" TSTR Fold {fold + 1} - Precision: " + str(precision_TSTR))
logging.info(f" TSTR Fold {fold + 1} - Recall: " + str(recall_TSTR))
logging.info(f" TSTR Fold {fold + 1} - F1 Score: " + str(f1_TSTR) + "\n")
logging.info("")
## cria uma lista com os nomes das métricas, será utilizada pelas ferramentas de rastreamento
ac='TSTR Accuracy '+f' Classifier Model {classifier_type[index]}'
pc='TSTR precision '+f' Classifier Model {classifier_type[index]}'
rr='TSTR Recall '+f' Classifier Model {classifier_type[index]}'
f1='TSTR f1 Score '+f' Classifier Model {classifier_type[index]}'
values={ac:accuracy_TSTR,pc:precision_TSTR,rr:recall_TSTR,f1:f1_TSTR}
##Salvamento das métricas no dicionário de métricas
dict["TSTR accuracy"][classifier_type[index]].append(accuracy_TSTR)
dict["TSTR precision"][classifier_type[index]].append(precision_TSTR)
dict["TSTR F1 score"][classifier_type[index]].append(f1_TSTR)
dict["TSTR recall"][classifier_type[index]].append(recall_TSTR)
##calculo das métricas da curva de ROC
fpr, tpr,thresholds=metrics.roc_curve(y_sample_TSTR, y_predict_prob)
##plot da figura da curva de ROC
plt.figure()
Path(os.path.join(output_dir, path_confusion_matrix)).mkdir(parents=True, exist_ok=True)
roc_file = os.path.join(output_dir, path_confusion_matrix,f'Roc_curve_TSTR_{classifier_type[index]}_k{fold + 1}.jpg')
auc=metrics.roc_auc_score(y_sample_TSTR, y_predict_prob)
plt.plot(fpr, tpr)
plt.savefig(roc_file, bbox_inches="tight")
##Salvamento do AUC no dicnário TRTS
TSTR_aucs[classifier_type[index]].append(auc)
if generate_confusion_matrix:
##realiza o plot da figura da matrix de confusão
plt.figure()
selected_color_map = plt.colormaps.get_cmap(DEFAULT_COLOR_NAME[(fold + 2) % len(DEFAULT_COLOR_NAME)])
confusion_matrix_instance = PlotConfusionMatrix()
confusion_matrix_instance.plot_confusion_matrix(confusion_matrix_TSTR, out_label, selected_color_map)
Path(os.path.join(output_dir, path_confusion_matrix)).mkdir(parents=True, exist_ok=True)
matrix_file = os.path.join(output_dir, path_confusion_matrix,
f'CM_TSTR_{classifier_type[index]}_k{fold + 1}.jpg')
matrix=plt.savefig(matrix_file, bbox_inches='tight')
cm_image = plot_to_image(matrix_file)
## opção para salvamento das figuras geradas e as métricas obtidas, na ferramenta de rastreamento TensorBoard
if USE_TENSORBOARD:
with file_writer.as_default():
tf.summary.image(f'CM_TSTR_{classifier_type[index]}_k{fold + 1}', cm_image,step=fold+1)
tf.summary.scalar(ac, data=accuracy_TSTR, step=fold+1)
tf.summary.scalar(pc, data=precision_TSTR, step=fold+1)
tf.summary.scalar(rr, data=recall_TSTR, step=fold+1)
tf.summary.scalar(f1, data=f1_TSTR, step=fold+1)
## ## opção para salvamento das figuras geradas e as métricas obtidas, na ferramenta de rastreamento Aimstack
if USE_AIM:
aim_run.track(values)
plt.savefig(matrix_file, bbox_inches='tight')
aim_image = Image(matrix_file)
aim_run.track(value=aim_image, name=f'CM_TSTR_{classifier_type[index]}_k{fold + 1}')
## opção para salvamento das figuras geradas e as métricas obtidas, na ferramenta de rastreamento Mlflow
if USE_MLFLOW:
mlflow.log_metrics(values,step=fold+1)
mlflow.log_artifact(matrix_file, 'images')
def evaluate_TRTR_data(list_classifiers, x_TRTR, y_TRTR, fold, k, generate_confusion_matrix, output_dir,
classifier_type, out_label, path_confusion_matrix, verbose_level,dict,TRTR_aucs):
"""
Avalia os do classificador TSTR(Treinado com dados sintéticos/ Avaliado com dados reais)
Parâmetros:
- list_classifiers: lista de classificadores
- x_TRTR: dados reais para serem evaluados
- y_TRTR: rótulos dos dados reais
- fold: índice da iteração atual
- k: índice da subdivisão atual
- generate_confusion_matrix: flag para geração de matriz de confusão
- output_dir: diretório de saída
- classifier_type: tipo de classificador
- out_label: rótulo de saída
- path_confusion_matrix: caminho para salvar matriz de confusão
- verbose_level: nível de verbosidade
- dict: dicionário para armazenar resultados das métricas de utilidade
- syn_aucs: lista para armazenar AUCs
Retorna:
- dict: dicionário atualizado com resultados
- syn_aucs: lista atualizada com AUCs
"""
logging.info(f"TSTR Fold {fold + 1}/{k} results")
instance_metrics = ProbabilisticMetrics()
y_predict_prob=[]
## Itera sobre a lista dos classificadores
for index, classifier_model in enumerate(list_classifiers):
## obtém a predição do classificador em relação aos dados
if classifier_type[index] == "Perceptron":
y_predicted_TRTR = classifier_model.predict(x_TRTR, verbose=DEFAULT_VERBOSE_LIST[verbose_level])
y_predicted_TRTR = np.rint(np.squeeze(y_predicted_TRTR, axis=1))
y_predict_prob=y_predicted_TRTR
else:
print(classifier_type[index])
y_predicted_TRTR = classifier_model.predict(x_TRTR)
y_predict_prob=classifier_model.predict_proba(x_TRTR)[::,1]
y_predicted_TRTR = y_predicted_TRTR.astype(int)
y_sample_TRTR = y_TRTR.astype(int)
##cria uma matrix de confusão
confusion_matrix_TRTR = confusion_matrix(y_sample_TRTR, y_predicted_TRTR)
##Obtem as métricas de utilidade do classificador
accuracy_TRTR = instance_metrics.get_accuracy(y_sample_TRTR, y_predicted_TRTR)
precision_TRTR = instance_metrics.get_precision(y_sample_TRTR, y_predicted_TRTR)
recall_TRTR = instance_metrics.get_recall(y_sample_TRTR, y_predicted_TRTR)
f1_TRTR = instance_metrics.get_f1_score(y_sample_TRTR, y_predicted_TRTR)
##Realiza o logging das métricas de fidelidade obtidas
logging.info(f" Classifier Model: {classifier_type[index]}")
logging.info(f" TRTR Fold {fold + 1} - Confusion Matrix:")
logging.info(confusion_matrix_TRTR)
logging.info(f"\n Classifier Metrics:")
logging.info(f" TRTR Fold {fold + 1} - Accuracy: " + str(accuracy_TRTR))
logging.info(f" TRTR Fold {fold + 1} - Precision: " + str(precision_TRTR))
logging.info(f" TRTR Fold {fold + 1} - Recall: " + str(recall_TRTR))
logging.info(f" TRTR Fold {fold + 1} - F1 Score: " + str(f1_TRTR) + "\n")
logging.info("")
## cria uma lista com os nomes das métricas, será utilizada pelas ferramentas de rastreamento
ac='TRTR Accuracy '+f' Classifier Model {classifier_type[index]}'
pc='TRTR precision '+f' Classifier Model {classifier_type[index]}'
rr='TRTR Recall '+f' Classifier Model {classifier_type[index]}'
f1='TRTR f1 Score '+f' Classifier Model {classifier_type[index]}'
values={ac:accuracy_TRTR,pc:precision_TRTR,rr:recall_TRTR,f1:f1_TRTR}
##Salvamento das métricas no dicionário de métricas
dict["TRTR accuracy"][classifier_type[index]].append(accuracy_TRTR)
dict["TRTR precision"][classifier_type[index]].append(precision_TRTR)
dict["TRTR F1 score"][classifier_type[index]].append(f1_TRTR)
dict["TRTR recall"][classifier_type[index]].append(recall_TRTR)
##calculo das métricas da curva de ROC
fpr, tpr,thresholds=metrics.roc_curve(y_sample_TRTR, y_predict_prob)
##plot da figura da curva de ROC
plt.figure()
Path(os.path.join(output_dir, path_confusion_matrix)).mkdir(parents=True, exist_ok=True)
roc_file = os.path.join(output_dir, path_confusion_matrix,f'Roc_curve_TSTR_{classifier_type[index]}_k{fold + 1}.jpg')
auc=metrics.roc_auc_score(y_sample_TRTR, y_predict_prob)
plt.plot(fpr, tpr)
plt.savefig(roc_file, bbox_inches="tight")
##Salvamento do AUC no dicnário TRTS
#TRTR_aucs[classifier_type[index]].append(auc)
if generate_confusion_matrix:
##realiza o plot da figura da matrix de confusão
plt.figure()
selected_color_map = plt.colormaps.get_cmap(DEFAULT_COLOR_NAME[(fold + 2) % len(DEFAULT_COLOR_NAME)])
confusion_matrix_instance = PlotConfusionMatrix()
confusion_matrix_instance.plot_confusion_matrix(confusion_matrix_TRTR, out_label, selected_color_map)
Path(os.path.join(output_dir, path_confusion_matrix)).mkdir(parents=True, exist_ok=True)
matrix_file = os.path.join(output_dir, path_confusion_matrix,
f'CM_TSTR_{classifier_type[index]}_k{fold + 1}.jpg')
matrix=plt.savefig(matrix_file, bbox_inches='tight')
cm_image = plot_to_image(matrix_file)
## opção para salvamento das figuras geradas e as métricas obtidas, na ferramenta de rastreamento TensorBoard
if USE_TENSORBOARD:
with file_writer.as_default():
tf.summary.image(f'CM_TSTR_{classifier_type[index]}_k{fold + 1}', cm_image,step=fold+1)
tf.summary.scalar(ac, data=accuracy_TRTR, step=fold+1)
tf.summary.scalar(pc, data=precision_TRTR, step=fold+1)
tf.summary.scalar(rr, data=recall_TRTR, step=fold+1)
tf.summary.scalar(f1, data=f1_TRTR, step=fold+1)
## ## opção para salvamento das figuras geradas e as métricas obtidas, na ferramenta de rastreamento Aimstack
if USE_AIM:
aim_run.track(values)
plt.savefig(matrix_file, bbox_inches='tight')
aim_image = Image(matrix_file)
aim_run.track(value=aim_image, name=f'CM_TSTR_{classifier_type[index]}_k{fold + 1}')
## opção para salvamento das figuras geradas e as métricas obtidas, na ferramenta de rastreamento Mlflow
if USE_MLFLOW:
mlflow.log_metrics(values,step=fold+1)
mlflow.log_artifact(matrix_file, 'images')
def p_value_test (TSTR_label,TRTS_label,type_of_metric,classifier_type):
"""
A função calcula o valor-p (p-value) utilizando o teste de Wilcoxon para amostras pareadas das métricas de utilidade dos classificadores.
Parâmetros:
-TSTR_label : Dicionário contendo os dados dos classificadores TSTR, onde as chaves são os tipos de classificadores
e os valores são listas ou arrays com os dados.
-TRTS_label : Dicionário contendo os dados dos classificadores TRTS, onde as chaves são os tipos de
classificadores e os valores são listas ou arrays com os dados.
-type_of_metric : Uma string que representa o tipo de métrica que está sendo testada.
-classifier_type : Uma string que representa o tipo de classificador cujos dados serão comparados.
Retorna:
-p_value: O valor-p resultante do teste de Wilcoxon.
"""
TSTR=[]
TRTS=[]
estaticts=0
p_value=0
TSTR=np.asfarray(TSTR_label[classifier_type])
TRTS=np.asfarray(TRTS_label[classifier_type])
estaticts, p_value = stats.wilcoxon(TSTR,TRTS,alternative='two-sided')
logging.info(" P_value of {} {} and stats {} of {} \n".format(type_of_metric,p_value,estaticts,classifier_type))
return p_value
def show_and_export_results(dict_similarity, classifier_type, output_dir, title_output_label, dict_metrics, dict_TRTS_auc, dict_TSTR_auc):
"""
Função para demonstrar e exportar resultados de métricas de fidelidade e utilidade, além da chamada de criação dos plots destas métricas.
Parâmetros:
-dict_similarity : Dicionário contendo listas de métricas de fidelidade entre os dados.
-classifier_type : Lista de classificadores.
-output_dir (: Diretório de saída para salvar os resultados.
-title_output_label : Título do rótulo de saída.
-dict_metrics : Dicionário contendo listas de métricas (ex. precisão, recall, etc.).
-dict_TRTS_auc : Dicionário contendo AUC para os classificadores TRTS.
-dict_TSTR_auc : Dicionário contendo AUC para os classificadores TSTR.
"""
## Inicializa as classes para plotar métricas
plot_classifier_metrics = PlotClassificationMetrics()
plot_fidelity_metrics = PlotFidelityeMetrics()
## Itera sobre os classificadores
for index in range(len(classifier_type)):
## Logging dos resultados dos classificadores TRTS
logging.info("Overall TRTS Results: Classifier {}\n".format(classifier_type[index]))
logging.info(" TRTS List of Accuracies: {} ".format(dict_metrics["TRTS accuracy"][classifier_type[index]]))
logging.info(" TRTS List of Precisions: {} ".format(dict_metrics["TRTS precision"][classifier_type[index]]))
logging.info(" TRTS List of Recalls: {} ".format(dict_metrics["TRTS recall"][classifier_type[index]]))
logging.info(" TRTS List of F1-scores: {} ".format(dict_metrics["TRTS F1 score"][classifier_type[index]]))
logging.info(" TRTS list AUC: {} ".format((dict_TRTS_auc[classifier_type[index]])))
logging.info(" TRTS Mean Accuracy: {} ".format(np.mean(dict_metrics["TRTS accuracy"][classifier_type[index]])))
logging.info(" TRTS Mean Precision: {} ".format(np.mean(dict_metrics["TRTS precision"][classifier_type[index]])))
logging.info(" TRTS Mean Recall: {} ".format(np.mean(dict_metrics["TRTS recall"][classifier_type[index]])))
logging.info(" TRTS Mean F1 Score: {} ".format(np.mean(dict_metrics["TRTS F1 score"][classifier_type[index]])))
logging.info(" TRTS Mean AUC: {} ".format(np.mean(dict_TRTS_auc[classifier_type[index]])))
logging.info(" TRTS Standard Deviation of Accuracy: {} ".format(np.std(dict_metrics["TRTS accuracy"][classifier_type[index]])))
logging.info(" TRTS Standard Deviation of Precision: {} ".format(np.std(dict_metrics["TRTS precision"][classifier_type[index]])))
logging.info(" TRTS Standard Deviation of Recall: {} ".format(np.std(dict_metrics["TRTS recall"][classifier_type[index]])))
logging.info(" TRTS Standard Deviation of F1 Score: {} \n".format(np.std(dict_metrics["TRTS F1 score"][classifier_type[index]])))
logging.info(" TRTS Standard Deviation of AUC: {} ".format(np.std(dict_TRTS_auc[classifier_type[index]])))
#TESTE
logging.info("Overall TRTR Results: Classifier {}\n".format(classifier_type[index]))
logging.info(" TRTR List of Accuracies: {} ".format(dict_metrics["TRTR accuracy"][classifier_type[index]]))
logging.info(" TRTR List of Precisions: {} ".format(dict_metrics["TRTR precision"][classifier_type[index]]))
logging.info(" TRTR List of Recalls: {} ".format(dict_metrics["TRTR recall"][classifier_type[index]]))
logging.info(" TRTR List of F1-scores: {} ".format(dict_metrics["TRTR F1 score"][classifier_type[index]]))
#logging.info(" TRTR list AUC: {} ".format((dict_TRTS_auc[classifier_type[index]])))
logging.info(" TRTR Mean Accuracy: {} ".format(np.mean(dict_metrics["TRTR accuracy"][classifier_type[index]])))
logging.info(" TRTR Mean Precision: {} ".format(np.mean(dict_metrics["TRTS precision"][classifier_type[index]])))
logging.info(" TRTR Mean Recall: {} ".format(np.mean(dict_metrics["TRTR recall"][classifier_type[index]])))
logging.info(" TRTR Mean F1 Score: {} ".format(np.mean(dict_metrics["TRTR F1 score"][classifier_type[index]])))
#logging.info(" TRTR Mean AUC: {} ".format(np.mean(dict_TRTS_auc[classifier_type[index]])))
logging.info(" TRTR Standard Deviation of Accuracy: {} ".format(np.std(dict_metrics["TRTR accuracy"][classifier_type[index]])))
logging.info(" TRTR Standard Deviation of Precision: {} ".format(np.std(dict_metrics["TRTR precision"][classifier_type[index]])))
logging.info(" TRTR Standard Deviation of Recall: {} ".format(np.std(dict_metrics["TRTR recall"][classifier_type[index]])))
logging.info(" TRTR Standard Deviation of F1 Score: {} \n".format(np.std(dict_metrics["TRTR F1 score"][classifier_type[index]])))
#logging.info(" TRTR Standard Deviation of AUC: {} ".format(np.std(dict_TRTS_auc[classifier_type[index]])))
## Nome do plot
plot_filename_tstr = os.path.join(output_dir, f'{classifier_type[index]}_TSTR_(Treinado com sintético,avalia com dados reais)_.pdf')
plot_filename_trtr = os.path.join(output_dir, f'{classifier_type[index]}_TSTR_(Treinado com sintético,avalia com dados reais)_.pdf')
## Plota e salva as métricas dos classificadores TRTS
plot_classifier_metrics.plot_classifier_metrics(
classifier_type[index],
dict_metrics["TRTS accuracy"][classifier_type[index]],
dict_metrics["TRTS precision"][classifier_type[index]],
dict_metrics["TRTS recall"][classifier_type[index]],
dict_metrics["TRTS F1 score"][classifier_type[index]],
plot_filename_tstr,
f'{title_output_label}_TRTS', "TRTS"
)
plot_classifier_metrics.plot_classifier_metrics(
classifier_type[index],
dict_metrics["TRTR accuracy"][classifier_type[index]],
dict_metrics["TRTR precision"][classifier_type[index]],
dict_metrics["TRTR recall"][classifier_type[index]],
dict_metrics["TRTR F1 score"][classifier_type[index]],
plot_filename_trtr,
f'{title_output_label}_TRTR', "TRTR"
)
## Define os nomes das métricas TRTS para as ferramentas de rastreamento
ac = 'TRTS Mean Accuracy ' + f' Classifier Model {classifier_type[index]}'
pc = 'TRTS Mean Precision ' + f' Classifier Model {classifier_type[index]}'
rr = 'TRTS Mean Recall ' + f' Classifier Model {classifier_type[index]}'
f1 = 'TRTS Mean F1 Score ' + f' Classifier Model {classifier_type[index]}'
pct = 'TRTS Standard Deviation of Precision ' + f'Classifier Model {classifier_type[index]}'
act = 'TRTS Standard Deviation of Accuracy ' + f' Classifier Model {classifier_type[index]}'
rrt = 'TRTS Standard Deviation of Recall ' + f' Classifier Model {classifier_type[index]}'
f1t = 'TRTS Standard Deviation of F1 Score ' + f' Classifier Model {classifier_type[index]}'
## Rastreamento das métricas utilizando Aimstack
if USE_AIM:
values = {
ac: np.mean(dict_metrics["TRTS accuracy"][classifier_type[index]]),
pc: np.mean(dict_metrics["TRTS precision"][classifier_type[index]]),
rr: np.mean(dict_metrics["TRTS recall"][classifier_type[index]]),
f1: np.mean(dict_metrics["TRTS F1 score"][classifier_type[index]]),
act: np.std(dict_metrics["TRTS accuracy"][classifier_type[index]]),
pct: np.std(dict_metrics["TRTS precision"][classifier_type[index]]),
rrt: np.std(dict_metrics["TRTS recall"][classifier_type[index]]),
f1t: np.std(dict_metrics["TRTS F1 score"][classifier_type[index]]),
}
aim_run.track(values, context={'data': 'TRTS', 'classifier_type': classifier_type[index]})
## Rastreamento das métricas utilizando Mlflow
if USE_MLFLOW:
values = {
ac: np.mean(dict_metrics["TRTS accuracy"][classifier_type[index]]),
pc: np.mean(dict_metrics["TRTS precision"][classifier_type[index]]),
rr: np.mean(dict_metrics["TRTS recall"][classifier_type[index]]),
f1: np.mean(dict_metrics["TRTS F1 score"][classifier_type[index]]),
act: np.std(dict_metrics["TRTS accuracy"][classifier_type[index]]),
pct: np.std(dict_metrics["TRTS precision"][classifier_type[index]]),
rrt: np.std(dict_metrics["TRTS recall"][classifier_type[index]]),
f1t: np.std(dict_metrics["TRTS F1 score"][classifier_type[index]]),
}
mlflow.log_metrics(values)
## Rastreamento das métricas utilizando TensorBoard
if USE_TENSORBOARD:
with file_writer.as_default():
tf.summary.scalar(ac, data=np.mean(dict_metrics["TRTS accuracy"][classifier_type[index]]), step=0)
tf.summary.scalar(pc, data=np.mean(dict_metrics["TRTS precision"][classifier_type[index]]), step=0)
tf.summary.scalar(rr, data=np.mean(dict_metrics["TRTS recall"][classifier_type[index]]), step=0)
tf.summary.scalar(f1, data=np.mean(dict_metrics["TRTS F1 score"][classifier_type[index]]), step=0)
tf.summary.scalar(act, data=np.std(dict_metrics["TRTS accuracy"][classifier_type[index]]), step=0)
tf.summary.scalar(pct, data=np.std(dict_metrics["TRTS precision"][classifier_type[index]]), step=0)
tf.summary.scalar(rrt, data=np.std(dict_metrics["TRTS recall"][classifier_type[index]]), step=0)
tf.summary.scalar(f1t, data=np.std(dict_metrics["TRTS F1 score"][classifier_type[index]]), step=0)
## logging dos resultados dos classificadores TSTR
logging.info("Overall TSTR Results: {}\n".format(classifier_type[index]))
logging.info(" TSTR List of Accuracies: {} ".format(dict_metrics["TSTR accuracy"][classifier_type[index]]))
logging.info(" TSTR List of Precisions: {} ".format(dict_metrics["TSTR precision"][classifier_type[index]]))
logging.info(" TSTR List of Recalls: {} ".format(dict_metrics["TSTR recall"][classifier_type[index]]))
logging.info(" TSTR List of F1-scores: {} ".format(dict_metrics["TSTR F1 score"][classifier_type[index]]))
logging.info(" TSTR list AUC: {} ".format((dict_TSTR_auc[classifier_type[index]])))
logging.info(" TSTR Mean Accuracy: {} ".format(np.mean(dict_metrics["TSTR accuracy"][classifier_type[index]])))
logging.info(" TSTR Mean Precision: {} ".format(np.mean(dict_metrics["TSTR precision"][classifier_type[index]])))
logging.info(" TSTR Mean Recall: {} ".format(np.mean(dict_metrics["TSTR recall"][classifier_type[index]])))
logging.info(" TSTR Mean F1 Score: {} ".format(np.mean(dict_metrics["TSTR F1 score"][classifier_type[index]])))
logging.info(" TSTR Mean AUC: {} ".format(np.mean(dict_TSTR_auc[classifier_type[index]])))
logging.info(" TSTR Standard Deviation of Accuracy: {} ".format(np.std(dict_metrics["TSTR accuracy"][classifier_type[index]])))
logging.info(" TSTR Standard Deviation of Precision: {} ".format(np.std(dict_metrics["TSTR precision"][classifier_type[index]])))
logging.info(" TSTR Standard Deviation of Recall: {} ".format(np.std(dict_metrics["TSTR recall"][classifier_type[index]])))
logging.info(" TSTR Standard Deviation of F1 Score: {} \n".format(np.std(dict_metrics["TSTR F1 score"][classifier_type[index]])))
logging.info(" TSTR Standard Deviation of AUC: {} ".format(np.std(dict_TSTR_auc[classifier_type[index]])))
## Nome do plot
plot_filename = os.path.join(output_dir, f'{classifier_type[index]}_treiando_com_sint_testado_com_TSTR.pdf')
## Plota e salva as métricas dos classificadores TSTR
plot_classifier_metrics.plot_classifier_metrics(
classifier_type[index],
dict_metrics["TSTR accuracy"][classifier_type[index]],
dict_metrics["TSTR precision"][classifier_type[index]],
dict_metrics["TSTR recall"][classifier_type[index]],
dict_metrics["TSTR F1 score"][classifier_type[index]],
plot_filename,
f'{title_output_label}_TSTR', "TSTR"
)
## Define os nomes das métricas TSTR para as ferramentas de rastreamento
ac = 'TSTR Mean Accuracy ' + f' Classifier Model {classifier_type[index]}'
pc = 'TSTR Mean Precision ' + f' Classifier Model {classifier_type[index]}'
rr = 'TSTR Mean Recall ' + f' Classifier Model {classifier_type[index]}'
f1 = 'TSTR Mean f1 Score ' + f' Classifier Model {classifier_type[index]}'
pct = 'TSTR Standart Deviation of PreCision ' + f'Classifier Model {classifier_type[index]}'
act = 'TSTR Standard Deviation of Accuracy ' + f' Classifier Model {classifier_type[index]}'
rrt = 'TSTR Standard Deviation of Recall ' + f' Classifier Model {classifier_type[index]}'
f1t = 'TSTR Standard Deviation of F1 Score ' + f' Classifier Model {classifier_type[index]}'
## Rastreamento das métricas utilizando Aimstack
if USE_AIM:
aim_run.track(values, context={'data': 'TSTR', 'classifir_type': classifier_type[index]})
## Rastreamento das métricas utilizando Mlflow
if USE_MLFLOW:
mlflow.log_metrics(values)
## Rastreamento das métricas utilizando TensorBoard
if USE_TENSORBOARD:
with file_writer.as_default():
tf.summary.scalar(ac, data=np.mean(dict_metrics["TSTR accuracy"][classifier_type[index]]), step=0)
tf.summary.scalar(pc, data=np.mean(dict_metrics["TSTR precision"][classifier_type[index]]), step=0)
tf.summary.scalar(rr, data=np.mean(dict_metrics["TSTR recall"][classifier_type[index]]), step=0)
tf.summary.scalar(f1, data=np.mean(dict_metrics["TSTR F1 score"][classifier_type[index]]), step=0)
tf.summary.scalar(act, data=np.std(dict_metrics["TSTR accuracy"][classifier_type[index]]), step=0)
tf.summary.scalar(pct, data=np.std(dict_metrics["TSTR precision"][classifier_type[index]]), step=0)
tf.summary.scalar(rrt, data=np.std(dict_metrics["TSTR recall"][classifier_type[index]]), step=0)
tf.summary.scalar(f1t, data=np.std(dict_metrics["TSTR F1 score"][classifier_type[index]]), step=0)
## Logging das métricas fidelidade entre os dados sintéticos e reais
comparative_metrics = ['Mean Squared Error', 'Cosine Similarity', 'Max Mean Discrepancy']
comparative_lists = ["list_mean_squared_error", "list_cosine_similarity", "list_maximum_mean_discrepancy"]
logging.info(f"Comparative Metrics:")
for metric, comparative_list in zip(comparative_metrics, comparative_lists):
logging.info("\t{}".format(metric))
for i in ["false", "positive"]:
logging.info("\t\t {}".format(i))
logging.info("\t\t{} - List : {}".format(metric, dict_similarity[comparative_list][i]))
logging.info("\t\t{} - Mean : {}".format(metric, np.mean(dict_similarity[comparative_list][i])))
logging.info("\t\t{} - Std. Dev. : {}\n".format(metric, np.std(dict_similarity[comparative_list][i])))
## Testes de valor-p
for index in range(len(classifier_type)):
p_value_test(dict_metrics["TSTR accuracy"], dict_metrics["TRTS accuracy"], "accuracy", classifier_type[index])
p_value_test(dict_metrics["TSTR precision"], dict_metrics["TRTS precision"], "precision", classifier_type[index])
p_value_test(dict_metrics["TSTR F1 score"], dict_metrics["TRTS F1 score"], "F1 score", classifier_type[index])
p_value_test(dict_metrics["TSTR recall"], dict_metrics["TRTS recall"], "recall", classifier_type[index])
p_value_test(dict_TSTR_auc, dict_TRTS_auc, "auc", classifier_type[index])
plot_filename = os.path.join(output_dir, f'{classifier_type[index]}_p_values.pdf')
## Plota e salva as métricas de fidelidade geradas
plot_filename1 = os.path.join(output_dir, f'Comparison_TSTR_TRTS_positive.jpg')
plot_filename2 = os.path.join(output_dir, f'Comparison_TSTR_TRTS_false.jpg')
plot_fidelity_metrics.plot_fidelity_metrics(
dict_similarity["list_mean_squared_error"]["positive"],
dict_similarity["list_cosine_similarity"]["positive"],
dict_similarity["list_maximum_mean_discrepancy"]["positive"],
plot_filename1,
f'{title_output_label}'
)
plot_fidelity_metrics.plot_fidelity_metrics(
dict_similarity["list_mean_squared_error"]["false"],
dict_similarity["list_cosine_similarity"]["false"],
dict_similarity["list_maximum_mean_discrepancy"]["false"],
plot_filename2,
f'{title_output_label}'
)
## Rastreamento das imagens utilizando Aimstack
if USE_AIM:
aim_image = Image(plot_filename1)
aim_image2 = Image(plot_filename2)
aim_run.track(value=aim_image, name=plot_filename1, context={'classifier_type': classifier_type[index]})
aim_run.track(value=aim_image2, name=plot_filename2, context={'classifier_type': classifier_type[index]})
## Rastreamento das imagens utilizando TensorBoard
if USE_TENSORBOARD:
with file_writer.as_default():
cm_image = plot_to_image(plot_filename)
tf.summary.image('Comparison_TSTR_TRTS.jpg', cm_image, step=0)
## Rastreamento das imagens utilizando Mlflow
if USE_MLFLOW:
mlflow.log_artifact(plot_filename1, 'images')
mlflow.log_artifact(plot_filename2, 'images')
def get_adversarial_model(latent_dim, input_data_shape, activation_function, initializer_mean, initializer_deviation,
dropout_decay_rate_g, dropout_decay_rate_d, last_layer_activation, dense_layer_sizes_g,
dense_layer_sizes_d, dataset_type, training_algorithm, latent_mean_distribution,
latent_stander_deviation,optimizer_discriminator_learning,optimizer_generator_learning):
"""
Função utilizada para a chamada do método de instanciamento da rede adversarial cGAN.
Parâmetros:
-latent_dim: Dimensão do espaço latente para treinamento cGAN.
-input_data_shape: Formato dos dados de entrada: Ex Float32
-activation_function: Função de ativação da cGAN.
-initializer_mean: Valor central da distribuição gaussiana do inicializador.
-initializer_deviation: Desvio padrão da distribuição gaussiana do inicializador.
-dropout_decay_rate_g: Taxa de decaimento do dropout do gerador da cGAN.
-dropout_decay_rate_d: Taxa de decaimento do dropout do discriminador da cGAN.
-last_layer_activation:
-dense_layer_sizes_g: Valores das camadas densas do gerador.
-dense_layer_sizes_d: Valores das camadas densas do discriminador
-training_algorithm:Algoritmo de treinamento para cGAN.
-latent_mean_distribution:Valor central da distribuição da camada latente.
-latent_stander_deviation: Desvio padrão da distribuição da camada latente.
Retorna:
-adversarial_model: Modelo adversarial instanciado e configurado
"""
## Criação de uma instância da Conditional GAN com os parâmetros especificados
instance_models = ConditionalGAN(latent_dim, input_data_shape, activation_function, initializer_mean,
initializer_deviation, dropout_decay_rate_g, dropout_decay_rate_d,
last_layer_activation, dense_layer_sizes_g, dense_layer_sizes_d, dataset_type)
## Obtenção dos modelos do gerador e do discriminador da instância criada
generator_model = instance_models.get_generator()
discriminator_model = instance_models.get_discriminator()
## Criação do modelo adversarial combinando o gerador e o discriminador
adversarial_model = AdversarialModel(generator_model, discriminator_model, latent_dimension=latent_dim,
latent_mean_distribution=latent_mean_distribution,
latent_stander_deviation=latent_stander_deviation,optimizer_discriminator=optimizer_discriminator_learning, optimizer_generator=optimizer_generator_learning)
## Configuração dos otimizadores para o gerador e o discriminador
optimizer_generator = adversarial_model.get_optimizer(training_algorithm)
optimizer_discriminator = adversarial_model.get_optimizer(training_algorithm)
## Definição das funções de perda para o gerador e o discriminador
loss_generator = BinaryCrossentropy()
loss_discriminator = BinaryCrossentropy()
adversarial_model.compile(optimizer_generator, optimizer_discriminator, loss_generator, loss_discriminator, loss=keras.losses.SparseCategoricalCrossentropy(),)
return adversarial_model
def show_model(latent_dim, input_data_shape, activation_function, initializer_mean,
initializer_deviation, dropout_decay_rate_g, dropout_decay_rate_d,
last_layer_activation, dense_layer_sizes_g, dense_layer_sizes_d,
dataset_type, verbose_level):
"""
A função imprime os parametros da rede adversarial no log de saida.
Parâmetros:
-latent_dim: Dimensão do espaço latente para treinamento cGAN.
-input_data_shape: Formato dos dados de entrada (número de linhas e colunas).
-activation_function: Função de ativação da cGAN.
-initializer_mean: Valor central da distribuição gaussiana do inicializador.
-initializer_deviation: Desvio padrão da distribuição gaussiana do inicializador.
-dropout_decay_rate_g: Taxa de decaimento do dropout do gerador da cGAN.
-dropout_decay_rate_d: Taxa de decaimento do dropout do discriminador da cGAN.
-last_layer_activation: Função de ativação para a última camada do gerador
-dense_layer_sizes_g: Valores das camadas densas do gerador.
-dense_layer_sizes_d: Valores das camadas densas do discriminador
-training_algorithm:Algoritmo de treinamento para cGAN.
-latent_mean_distribution:Valor central da distribuição da camada latente.
-latent_stander_deviation: Desvio padrão da distribuição da camada latente.
"""
show_model_instance = ConditionalGAN(latent_dim, input_data_shape, activation_function, initializer_mean,
initializer_deviation, dropout_decay_rate_g, dropout_decay_rate_d,
last_layer_activation, dense_layer_sizes_g, dense_layer_sizes_d,
dataset_type)
def run_experiment(dataset, input_data_shape, k, classifier_list, output_dir, batch_size, training_algorithm,
number_epochs, latent_dim, activation_function, dropout_decay_rate_g, dropout_decay_rate_d,
dense_layer_sizes_g=None, dense_layer_sizes_d=None, dataset_type=None, title_output=None,
initializer_mean=None, initializer_deviation=None,
last_layer_activation=DEFAULT_CONDITIONAL_LAST_ACTIVATION_LAYER, save_models=False,
path_confusion_matrix=None, path_curve_loss=None, verbose_level=None,
latent_mean_distribution=None, latent_stander_deviation=None, num_samples_class_malware=None, num_samples_class_benign=None,optimizer_discriminator_learning=None,optimizer_generator_learning=None):
"""
Responsável pelo principal fluxo de execução da cGAN, realiza as chamada das funções de:
- Treino da cGAN.
- Geração de dados sintéticos.
- Comparação de dados.
- Cálculo de métricas de utilidade e fidelidade.
- Export de resultados
Parâmetros:
- dataset: Dataset de entrada no formato CSV.
- input_data_shape: Formato dos dados de entrada (número de linhas e colunas).
- k: Número de folds a serem realizados durante o experimento (K-fold cross-validation).
- classifier_list: Lista dos classificadores a serem utilizados para a avaliação da performance da cGAN.
- output_dir: Diretório de saída para salvar os resultados e modelos.
- batch_size: Tamanho do batch para treinamento.
- training_algorithm: Algoritmo de treinamento a ser utilizado.
- number_epochs: Número de épocas para treinamento.
- latent_dim: Dimensão do espaço latente.
- activation_function: Função de ativação para as camadas internas.
- dropout_decay_rate_g: Taxa de dropout para o gerador.
- dropout_decay_rate_d: Taxa de dropout para o discriminador.
- dense_layer_sizes_g: Tamanhos das camadas densas do gerador.
- dense_layer_sizes_d: Tamanhos das camadas densas do discriminador.
- dataset_type: Tipo de dados do dataset.